Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bcl11bQ99PV8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcl11bQ99PV8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms