Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dhx30Q99PU8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dhx30Q99PU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dhx30Q99PU8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dhx30Q99PU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dhx30Q99PU8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dhx30Q99PU8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dhx30Q99PU8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dhx30Q99PU8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dhx30Q99PU8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms