Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms