Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcg5Q99PE8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms