Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RtcbQ99LF4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms