Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pagr1aQ99L02 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pagr1aQ99L02 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms