Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ciao1Q99KN2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ciao1Q99KN2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms