Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps4Q99KG7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps4Q99KG7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms