Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Me2Q99KE1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms