Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cldn16Q925N4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cldn16Q925N4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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