Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfdQ925I7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfdQ925I7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms