Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clip1Q922J3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clip1Q922J3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms