Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rpe65Q91ZQ5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rpe65Q91ZQ5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rpe65Q91ZQ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rpe65Q91ZQ5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rpe65Q91ZQ5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rpe65Q91ZQ5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Rpe65Q91ZQ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpe65Q91ZQ5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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