Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd3Q91W18 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd3Q91W18 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd3Q91W18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms