Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc44a4Q91VA1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a4Q91VA1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a4Q91VA1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms