Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms