Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4cQ8VCD7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms