Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim29Q8R2Q0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim29Q8R2Q0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms