Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg10Q8R1P4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg10Q8R1P4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms