Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk5rap2Q8K389 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk5rap2Q8K389 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms