Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shtn1Q8K2Q9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shtn1Q8K2Q9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms