Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Depp1Q8K2F3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Depp1Q8K2F3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms