Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FgbQ8K0E8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FgbQ8K0E8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FgbQ8K0E8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms