Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CopaQ8CIE6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CopaQ8CIE6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms