Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrc9Q8CDN9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc9Q8CDN9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms