Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E4f1Q8CCE9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E4f1Q8CCE9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms