Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc90bQ8C3X2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms