Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc4Q8BKW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms