Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy1Q8BIJ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms