Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl2Q8BG73 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl2Q8BG73 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Sh3bgrl2Q8BG73 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Sh3bgrl2Q8BG73 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms