Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prima1Q810F0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prima1Q810F0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms