Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5bQ80Y84 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5bQ80Y84 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5bQ80Y84 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm5bQ80Y84 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms