Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc155Q80VJ8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc155Q80VJ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms