Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc22a20Q80UJ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms