Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll4Q80UG8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll4Q80UG8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll4Q80UG8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttll4Q80UG8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttll4Q80UG8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttll4Q80UG8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ttll4Q80UG8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ttll4Q80UG8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Ttll4Q80UG8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ttll4Q80UG8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ttll4Q80UG8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ttll4Q80UG8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll4Q80UG8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttll4Q80UG8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttll4Q80UG8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll4Q80UG8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll4Q80UG8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll4Q80UG8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll4Q80UG8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll4Q80UG8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttll4Q80UG8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms