Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf516Q7TSH3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms