Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letm2Q7TNU7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letm2Q7TNU7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms