Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vma21Q78T54 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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