Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed3Q78IS1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms