Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme8Q715T0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms