Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2r2Q6ZWZ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms