Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Syne2Q6ZWQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms