Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc1Q6TDU8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc1Q6TDU8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms