Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2b4Q6Q477 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b4Q6Q477 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms