Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc57Q6PHN1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms