Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mfsd13aQ6PDE8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms