Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkab2Q6PAM0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkab2Q6PAM0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkab2Q6PAM0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab2Q6PAM0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab2Q6PAM0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms