Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6N5

Spred3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spred3Q6P6N5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spred3Q6P6N5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spred3Q6P6N5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms