Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg2aQ6P4T0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms