Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrimpolQ6P1E7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrimpolQ6P1E7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms